Snakemake Wrappers
0.27.0
Wrappers
BCFTOOLS
BOWTIE2
BUSCO
BWA
CAIROSVG
CUTADAPT
DELLY
EPIC
FASTQ_SCREEN
FASTQC
FREEBAYES
GATK
Wrappers
GATK BASERECALIBRATOR
GATK COMBINEGVCFS
GATK GENOTYPEGVCFS
GATK HAPLOTYPECALLER
GATK SELECTVARIANTS
GATK VARIANTFILTRATION
GATK VARIANTRECALIBRATOR
HISAT2
JANNOVAR
MINIMAP2
MULTIQC
NGS-DISAMBIGUATE
PICARD
PINDEL
RUBIC
SALMON
SAMBAMBA
SAMTOOLS
SICKLE
SNPEFF
SOURMASH
STAR
TRIM_GALORE
TRIMMOMATIC
TRINITY
VCF
VCFTOOLS
Snakemake Wrappers
Docs
»
GATK
Edit on Bitbucket
GATK
¶
Wrappers
¶
GATK BASERECALIBRATOR
GATK COMBINEGVCFS
GATK GENOTYPEGVCFS
GATK HAPLOTYPECALLER
GATK SELECTVARIANTS
GATK VARIANTFILTRATION
GATK VARIANTRECALIBRATOR
Read the Docs
v: 0.27.0
Versions
latest
stable
0.30.0
0.29.0
0.28.0
0.27.1
0.27.0
0.26.1
0.26.0
0.25.0
0.24.0
0.23.1
0.23.0
0.22.0
0.21.0
0.20.1
0.20.0
0.19.4
0.19.3
0.19.2
0.19.1
0.19.0
0.18.0
0.17.4
0.17.3
0.17.2
0.17.1
0.17.0
0.16.0
0.15.4
0.15.3
0.15.1
0.15.0
0.14.2
0.14.1
0.14.0
0.13.2
0.13.1
0.13.0
0.12.0
0.11.0
0.10.0
0.9.0
0.8.0
0.7.0
0.6.0
0.5.0
0.4.0
0.3.0
0.2.0
0.1.0
v0.0.13
0.0.13
0.0.12
0.0.11
0.0.10
0.0.9
0.0.8
0.0.7
0.0.6
0.0.5
0.0.4
0.0.3
0.0.2
0.0.1
Downloads
On Read the Docs
Project Home
Builds
Free document hosting provided by
Read the Docs
.