Snakemake Wrappers
0.30.0
Wrappers
BCFTOOLS
BOWTIE2
BUSCO
BWA
CUTADAPT
DELLY
EPIC
FASTQ_SCREEN
FASTQC
FGBIO
FREEBAYES
GATK
HISAT2
JANNOVAR
LOFREQ
MINIMAP2
MULTIQC
NGS-DISAMBIGUATE
PICARD
PINDEL
RUBIC
SALMON
SAMBAMBA
SAMTOOLS
Wrappers
SAMTOOLS FLAGSTAT
SAMTOOLS INDEX
SAMTOOLS MERGE
SAMTOOLS SORT
SAMTOOLS STATS
SAMTOOLS VIEW
SICKLE
SNPEFF
SOURMASH
STAR
TRIM_GALORE
TRIMMOMATIC
TRINITY
VCF
VCFTOOLS
Snakemake Wrappers
Docs
»
SAMTOOLS
Edit on Bitbucket
SAMTOOLS
¶
Wrappers
¶
SAMTOOLS FLAGSTAT
SAMTOOLS INDEX
SAMTOOLS MERGE
SAMTOOLS SORT
SAMTOOLS STATS
SAMTOOLS VIEW
Read the Docs
v: 0.30.0
Versions
latest
stable
0.31.0
0.30.0
0.29.0
0.28.0
0.27.1
0.27.0
0.26.1
0.26.0
0.25.0
0.24.0
0.23.1
0.23.0
0.22.0
0.21.0
0.20.1
0.20.0
0.19.4
0.19.3
0.19.2
0.19.1
0.19.0
0.18.0
0.17.4
0.17.3
0.17.2
0.17.1
0.17.0
0.16.0
0.15.4
0.15.3
0.15.1
0.15.0
0.14.2
0.14.1
0.14.0
0.13.2
0.13.1
0.13.0
0.12.0
0.11.0
0.10.0
0.9.0
0.8.0
0.7.0
0.6.0
0.5.0
0.4.0
0.3.0
0.2.0
0.1.0
v0.0.13
0.0.13
0.0.12
0.0.11
0.0.10
0.0.9
0.0.8
0.0.7
0.0.6
0.0.5
0.0.4
0.0.3
0.0.2
0.0.1
Downloads
On Read the Docs
Project Home
Builds
Free document hosting provided by
Read the Docs
.